1776年,德国动物学家斯塔提乌斯·穆勒在翻译林奈的《自然系统》时(拉丁文、德语),按照林奈的双名法将丹鹤命名为“Grus japonensis”译为日本鹤,并成为国际主流。只因当时清廷闭关锁国而在日本发现此鸟。
1980年,国际鹤类研究会上中国鸟类学泰斗郑作新教授力主改名,会议虽然正式通过了英文俗名“Red-crowned Crane”(丹顶鹤)。但是拉丁学名因国际命名规则无法改变,目前学术上仍然习惯称为“日本鹤”。
导致2004年国鸟评选,丹顶鹤虽然以64.92%的高票领先,但还是搁置评定。
目前普遍认为丹顶鹤起源于欧亚大陆,其主要繁殖地为中国东北和远东地区,不过1986年河南贾湖遗址出土的距今约9000年的丹顶鹤骨笛子、北京出土的12.6万年的丹顶鹤化石,都证明丹顶鹤与中国存在着深厚的渊源。
注:西方早就有传教士和商人在中国活动了,郎世宁这个意大利人还画过丹顶鹤。